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DNA甲基化分析可以識別血管肉瘤中的不同簇

來源:Aacrjournals2020-01-13

Aacrjournals 2020-01-13

目的:

DNA甲基化譜分析以前在許多腫瘤類型中均未發現具有生物學和臨床意義的亞組,但尚未在血管肉瘤中進行。血管肉瘤是一種罕見的肉瘤,臨床表現非常不同,可能是由于生物學背景的差異。在這項探索性研究中,對來自內臟,深部軟組織,輻射誘導和紫外線誘導定位的36例原發性血管肉瘤樣品進行了DNA甲基化分析。

實驗設計:

從全國范圍內的荷蘭血管肉瘤搜尋中收集內臟,軟組織,輻射誘發和紫外線誘發來源的原發性血管肉瘤福爾馬林固定石蠟包埋的樣本。提取DNA,用Illumina Infinium MethylationEPIC陣列進行甲基化分析。進行了質量控制評估和無監督的層次聚類。產生拷貝數概況并分析染色體穩定性。臨床數據來自荷蘭癌癥登記處。

結果:

通過對36個血管肉瘤樣品(6個內臟,5個軟組織,14個輻射誘導,11UV誘導)的無監督分層聚類進行DNA甲基化分析,發現了兩個主要簇(AB),分為四個子簇。這些聚類在很大程度上與臨床亞型相對應,顯示在聚類A1中由紫外線引起的病例和在聚類A2中由輻射引起的病例都豐富。內臟和軟組織病例幾乎完全落入B組。與B組相比,A組顯示出明顯的染色體不穩定性和更好的總體存活率(22vs.6個月,P=0.046)。

結論:

在這項新穎的甲基化分析研究中,我們首次證明了四個不同的血管肉瘤簇。這些簇與臨床亞型,總體存活率和染色體穩定性相關。

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